As Casas de Apoio surgiram na metade da década de 80 quando a emergência de acolher pessoas doentes de AIDS tornou-se necessária, a primeira Casa de Apoio do Pais foi a do GAPA-SP em 1985 que fechou seis meses depois.

Em 1988 surge a Casa de Apoio Brenda Lee originariamente feita para acolher travestis que ficavam doentes e não tinham onde ficar.

Hoje são 61 casas de apoio em todo o Estado sendo que 38 estão na capital e 23 no interior.

A comissão de Casa de Apoio surgiu no intuito de discutir e traçar estratégias que visem o desenvolvimento qualitativo desse trabalho, em 2001 A portaria Conjunta 2 CVS de 28 de Novembro que trata das condições de funcionamento das Casas de Apoio, veio de encontro com a necessidade de regulamentação dessa atividade e foi um trabalho conjunto entre Estado e sociedade civil. Em 28 de Outubro de 2002 surge o I Encontro Estadual de Casas de Apoio, o evento contou com a participação de representantes e usuários de 35 Casas de Apoio, além de profissionais da saúde.

Com o objetivo de promover discussões voltadas para a melhoria da qualidade de vida dos usuários das Casas de Apoio, os temas das mesas versaram sobre o Papel das Casas de Apoio frente à epidemia hoje; Caráter emancipatório no atendimento a pessoas em situação especial; Cidadania e Direitos - Estratégias de fortalecimento dos usuários das Casas de Apoio e canais de interlocução para encaminhamentos; Portaria Conjunta 2 CVS/CRT DST/Aids; Sustentabilidade - Planejamento, Gestão e Financiamento.